| Strain ID | Agave species | Community type | Confirmed ARA activity | SILVA Taxonomic lineage (NCBI best hit accession number) | DGGE cluster | |||||||||||||||
| MJ02 | A. tequilana | Root endosphere (re) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae. (NR_117704) | – | |||||||||||||||
| MJ03 | A. tequilana | Root endosphere (re) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae. (NR_117704) | – | |||||||||||||||
| MJ04 | A. tequilana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae. (NR_104933) | 1 | |||||||||||||||
| MJ05 | A. tequilana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_104933) | 1 | |||||||||||||||
| MJ06 | A. tequilana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_104933) | 1 | |||||||||||||||
| MJ07 | A. tequilana | Root endosphere (re) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_104934) | 1 | |||||||||||||||
| MJ08 | A. tequilana | Rhizosphere (rz) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Stenotrophomonas. (NR_041577) | 3 | |||||||||||||||
| MJ09 | A. tequilana | Rhizosphere (rz) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_044977) | 1 | |||||||||||||||
| MJ10 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | No | Bacteria. (NR_116033) (partial sequence) | – | |||||||||||||||
| MJ11 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | Yes | Bacteria; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus (NR_115953) | 2 | |||||||||||||||
| MJ13 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | No | Bacteria. (NR_117704) | – | |||||||||||||||
| MJ14 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | Yes | Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteria; Micrococcales; Microbacteriaceae; Microbacterium. (NR_044937) | – | |||||||||||||||
| MJ15 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_117704) | – | |||||||||||||||
| MJ17 | A. salmiana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Stenotrophomonas. (NR_041577) | 3 | |||||||||||||||
| MJ18 | A. salmiana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_117704) (partial sequence) | – | |||||||||||||||
| MJ19 | A. salmiana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_104933) | 1 | |||||||||||||||
| MJ20 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_044977) | 1 | |||||||||||||||
| MJ22 | A. salmiana | Phyllosphere (p) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodospirillales; Acetobacteraceae. (NR_109297) | – | |||||||||||||||
| Strain ID | Agave species | Community type | Confirmed ARA activity | SILVA Taxonomic lineage (NCBI best hit accession number) | DGGE cluster | |||||||||||||||
| MJ02 | A. tequilana | Root endosphere (re) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae. (NR_117704) | – | |||||||||||||||
| MJ03 | A. tequilana | Root endosphere (re) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae. (NR_117704) | – | |||||||||||||||
| MJ04 | A. tequilana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae. (NR_104933) | 1 | |||||||||||||||
| MJ05 | A. tequilana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_104933) | 1 | |||||||||||||||
| MJ06 | A. tequilana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_104933) | 1 | |||||||||||||||
| MJ07 | A. tequilana | Root endosphere (re) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_104934) | 1 | |||||||||||||||
| MJ08 | A. tequilana | Rhizosphere (rz) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Stenotrophomonas. (NR_041577) | 3 | |||||||||||||||
| MJ09 | A. tequilana | Rhizosphere (rz) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_044977) | 1 | |||||||||||||||
| MJ10 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | No | Bacteria. (NR_116033) (partial sequence) | – | |||||||||||||||
| MJ11 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | Yes | Bacteria; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus (NR_115953) | 2 | |||||||||||||||
| MJ13 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | No | Bacteria. (NR_117704) | – | |||||||||||||||
| MJ14 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | Yes | Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteria; Micrococcales; Microbacteriaceae; Microbacterium. (NR_044937) | – | |||||||||||||||
| MJ15 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_117704) | – | |||||||||||||||
| MJ17 | A. salmiana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Stenotrophomonas. (NR_041577) | 3 | |||||||||||||||
| MJ18 | A. salmiana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_117704) (partial sequence) | – | |||||||||||||||
| MJ19 | A. salmiana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_104933) | 1 | |||||||||||||||
| MJ20 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_044977) | 1 | |||||||||||||||
| MJ22 | A. salmiana | Phyllosphere (p) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodospirillales; Acetobacteraceae. (NR_109297) | – | |||||||||||||||
ARA, Acetylene reduction assay as described in Hardy et al. (1968).
Cluster 1: strains grouped with OTUs 60, 61, and 62; Cluster 2: strains grouped with OTU 31; Cluster 3: strains grouped with OTU 38.
| Strain ID | Agave species | Community type | Confirmed ARA activity | SILVA Taxonomic lineage (NCBI best hit accession number) | DGGE cluster | |||||||||||||||
| MJ02 | A. tequilana | Root endosphere (re) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae. (NR_117704) | – | |||||||||||||||
| MJ03 | A. tequilana | Root endosphere (re) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae. (NR_117704) | – | |||||||||||||||
| MJ04 | A. tequilana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae. (NR_104933) | 1 | |||||||||||||||
| MJ05 | A. tequilana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_104933) | 1 | |||||||||||||||
| MJ06 | A. tequilana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_104933) | 1 | |||||||||||||||
| MJ07 | A. tequilana | Root endosphere (re) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_104934) | 1 | |||||||||||||||
| MJ08 | A. tequilana | Rhizosphere (rz) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Stenotrophomonas. (NR_041577) | 3 | |||||||||||||||
| MJ09 | A. tequilana | Rhizosphere (rz) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_044977) | 1 | |||||||||||||||
| MJ10 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | No | Bacteria. (NR_116033) (partial sequence) | – | |||||||||||||||
| MJ11 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | Yes | Bacteria; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus (NR_115953) | 2 | |||||||||||||||
| MJ13 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | No | Bacteria. (NR_117704) | – | |||||||||||||||
| MJ14 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | Yes | Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteria; Micrococcales; Microbacteriaceae; Microbacterium. (NR_044937) | – | |||||||||||||||
| MJ15 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_117704) | – | |||||||||||||||
| MJ17 | A. salmiana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Stenotrophomonas. (NR_041577) | 3 | |||||||||||||||
| MJ18 | A. salmiana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_117704) (partial sequence) | – | |||||||||||||||
| MJ19 | A. salmiana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_104933) | 1 | |||||||||||||||
| MJ20 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_044977) | 1 | |||||||||||||||
| MJ22 | A. salmiana | Phyllosphere (p) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodospirillales; Acetobacteraceae. (NR_109297) | – | |||||||||||||||
| Strain ID | Agave species | Community type | Confirmed ARA activity | SILVA Taxonomic lineage (NCBI best hit accession number) | DGGE cluster | |||||||||||||||
| MJ02 | A. tequilana | Root endosphere (re) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae. (NR_117704) | – | |||||||||||||||
| MJ03 | A. tequilana | Root endosphere (re) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae. (NR_117704) | – | |||||||||||||||
| MJ04 | A. tequilana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae. (NR_104933) | 1 | |||||||||||||||
| MJ05 | A. tequilana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_104933) | 1 | |||||||||||||||
| MJ06 | A. tequilana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_104933) | 1 | |||||||||||||||
| MJ07 | A. tequilana | Root endosphere (re) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_104934) | 1 | |||||||||||||||
| MJ08 | A. tequilana | Rhizosphere (rz) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Stenotrophomonas. (NR_041577) | 3 | |||||||||||||||
| MJ09 | A. tequilana | Rhizosphere (rz) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_044977) | 1 | |||||||||||||||
| MJ10 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | No | Bacteria. (NR_116033) (partial sequence) | – | |||||||||||||||
| MJ11 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | Yes | Bacteria; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus (NR_115953) | 2 | |||||||||||||||
| MJ13 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | No | Bacteria. (NR_117704) | – | |||||||||||||||
| MJ14 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | Yes | Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteria; Micrococcales; Microbacteriaceae; Microbacterium. (NR_044937) | – | |||||||||||||||
| MJ15 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_117704) | – | |||||||||||||||
| MJ17 | A. salmiana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Stenotrophomonas. (NR_041577) | 3 | |||||||||||||||
| MJ18 | A. salmiana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_117704) (partial sequence) | – | |||||||||||||||
| MJ19 | A. salmiana | Root endosphere (re) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_104933) | 1 | |||||||||||||||
| MJ20 | A. salmiana | Rhizosphere (rz) | No | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae. (NR_044977) | 1 | |||||||||||||||
| MJ22 | A. salmiana | Phyllosphere (p) | Yes | Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodospirillales; Acetobacteraceae. (NR_109297) | – | |||||||||||||||
ARA, Acetylene reduction assay as described in Hardy et al. (1968).
Cluster 1: strains grouped with OTUs 60, 61, and 62; Cluster 2: strains grouped with OTU 31; Cluster 3: strains grouped with OTU 38.
This PDF is available to Subscribers Only
View Article Abstract & Purchase OptionsFor full access to this pdf, sign in to an existing account, or purchase an annual subscription.
