Correlation Analysis of LC/HFD-Induced Changes of Gene Expression and Biochemical Parameters
Gene . | CID . | Time . | Total Cholesterol . | HDL Cholesterol . | LDL Cholesterol . | NEFA . | PER1 . | PER2 . | PER3 . | TEF . | SIRT1 . | CD14 . | CD180 . | NFKBIA . | CCL3 . | ACOX3 . | IDH3A . |
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Cortisol | CID2/CID1 | 8:00 am | 0.381a | ||||||||||||||
11:15 am | |||||||||||||||||
3:45 pm | |||||||||||||||||
CID3/CID1 | 8:00 am | ||||||||||||||||
11:15 am | |||||||||||||||||
3:45 pm | |||||||||||||||||
PER1 | CID2/CID1 | 8:00 am | −0.369a | −0.380a | |||||||||||||
11:15 am | 0.393a | 0.374a | 0.412a | ||||||||||||||
3:45 pm | |||||||||||||||||
CID3/CID1 | 8:00 am | −0.456a | |||||||||||||||
11:15 am | 0.512b | 0.538b | 0.432a | ||||||||||||||
3:45 pm | 0.573b | 0.568b | 0.429a | ||||||||||||||
PER2 | CID2/CID1 | 8:00 am | |||||||||||||||
11:15 am | 0.475b | 0.455a | |||||||||||||||
3:45 pm | |||||||||||||||||
CID3/CID1 | 8:00 am | 0.461a | 0.601b | ||||||||||||||
11:15 am | 0.512b | 0.636b | 0.479b | ||||||||||||||
3:45 pm | 0.573b | 0.765b | |||||||||||||||
PER3 | CID2/CID1 | 8:00 am | 0.397a | ||||||||||||||
11:15 am | 0.393a | 0.474b | 0.441a | ||||||||||||||
3:45 pm | |||||||||||||||||
CID3/CID1 | 8:00 am | 0.601b | 0.450a | ||||||||||||||
11:15 am | 0.538b | 0.636b | 0.724b | ||||||||||||||
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TEF | CID2/CID1 | 8:00 am | 0.410a | ||||||||||||||
11:15 am | 0.374a | 0.455a | 0.553b | 0.397a | 0.462a | ||||||||||||
3:45 pm | |||||||||||||||||
CID3/CID1 | 8:00 am | 0.450a | 0.401a | ||||||||||||||
11:15 am | 0.432a | 0.479b | 0.724b | 0.438a | 0.590b | ||||||||||||
3:45 pm | 0.394a |
Gene . | CID . | Time . | Total Cholesterol . | HDL Cholesterol . | LDL Cholesterol . | NEFA . | PER1 . | PER2 . | PER3 . | TEF . | SIRT1 . | CD14 . | CD180 . | NFKBIA . | CCL3 . | ACOX3 . | IDH3A . |
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Cortisol | CID2/CID1 | 8:00 am | 0.381a | ||||||||||||||
11:15 am | |||||||||||||||||
3:45 pm | |||||||||||||||||
CID3/CID1 | 8:00 am | ||||||||||||||||
11:15 am | |||||||||||||||||
3:45 pm | |||||||||||||||||
PER1 | CID2/CID1 | 8:00 am | −0.369a | −0.380a | |||||||||||||
11:15 am | 0.393a | 0.374a | 0.412a | ||||||||||||||
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CID3/CID1 | 8:00 am | −0.456a | |||||||||||||||
11:15 am | 0.512b | 0.538b | 0.432a | ||||||||||||||
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PER2 | CID2/CID1 | 8:00 am | |||||||||||||||
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3:45 pm | |||||||||||||||||
CID3/CID1 | 8:00 am | 0.461a | 0.601b | ||||||||||||||
11:15 am | 0.512b | 0.636b | 0.479b | ||||||||||||||
3:45 pm | 0.573b | 0.765b | |||||||||||||||
PER3 | CID2/CID1 | 8:00 am | 0.397a | ||||||||||||||
11:15 am | 0.393a | 0.474b | 0.441a | ||||||||||||||
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CID3/CID1 | 8:00 am | 0.601b | 0.450a | ||||||||||||||
11:15 am | 0.538b | 0.636b | 0.724b | ||||||||||||||
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TEF | CID2/CID1 | 8:00 am | 0.410a | ||||||||||||||
11:15 am | 0.374a | 0.455a | 0.553b | 0.397a | 0.462a | ||||||||||||
3:45 pm | |||||||||||||||||
CID3/CID1 | 8:00 am | 0.450a | 0.401a | ||||||||||||||
11:15 am | 0.432a | 0.479b | 0.724b | 0.438a | 0.590b | ||||||||||||
3:45 pm | 0.394a |
Genes and parameters demonstrating significant expression changes in response on LC/HFD are shown (Supplemental Table 2). Parameter alterations were analyzed after 1 week (CID2/CID1) and 6 weeks (CID3/CID1) in the morning after overnight fasting (biochemical parameters) or at 3 time points (gene expression). Only significant correlation links (r values) are presented. Correlations significant after false discovery rate correction are in italics.
P < .05 without correction for multiple testing.
P < 0.01 without correction for multiple testing.
Correlation Analysis of LC/HFD-Induced Changes of Gene Expression and Biochemical Parameters
Gene . | CID . | Time . | Total Cholesterol . | HDL Cholesterol . | LDL Cholesterol . | NEFA . | PER1 . | PER2 . | PER3 . | TEF . | SIRT1 . | CD14 . | CD180 . | NFKBIA . | CCL3 . | ACOX3 . | IDH3A . |
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Cortisol | CID2/CID1 | 8:00 am | 0.381a | ||||||||||||||
11:15 am | |||||||||||||||||
3:45 pm | |||||||||||||||||
CID3/CID1 | 8:00 am | ||||||||||||||||
11:15 am | |||||||||||||||||
3:45 pm | |||||||||||||||||
PER1 | CID2/CID1 | 8:00 am | −0.369a | −0.380a | |||||||||||||
11:15 am | 0.393a | 0.374a | 0.412a | ||||||||||||||
3:45 pm | |||||||||||||||||
CID3/CID1 | 8:00 am | −0.456a | |||||||||||||||
11:15 am | 0.512b | 0.538b | 0.432a | ||||||||||||||
3:45 pm | 0.573b | 0.568b | 0.429a | ||||||||||||||
PER2 | CID2/CID1 | 8:00 am | |||||||||||||||
11:15 am | 0.475b | 0.455a | |||||||||||||||
3:45 pm | |||||||||||||||||
CID3/CID1 | 8:00 am | 0.461a | 0.601b | ||||||||||||||
11:15 am | 0.512b | 0.636b | 0.479b | ||||||||||||||
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PER3 | CID2/CID1 | 8:00 am | 0.397a | ||||||||||||||
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CID3/CID1 | 8:00 am | 0.601b | 0.450a | ||||||||||||||
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TEF | CID2/CID1 | 8:00 am | 0.410a | ||||||||||||||
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CID3/CID1 | 8:00 am | 0.450a | 0.401a | ||||||||||||||
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Gene . | CID . | Time . | Total Cholesterol . | HDL Cholesterol . | LDL Cholesterol . | NEFA . | PER1 . | PER2 . | PER3 . | TEF . | SIRT1 . | CD14 . | CD180 . | NFKBIA . | CCL3 . | ACOX3 . | IDH3A . |
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Cortisol | CID2/CID1 | 8:00 am | 0.381a | ||||||||||||||
11:15 am | |||||||||||||||||
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CID3/CID1 | 8:00 am | ||||||||||||||||
11:15 am | |||||||||||||||||
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PER1 | CID2/CID1 | 8:00 am | −0.369a | −0.380a | |||||||||||||
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CID3/CID1 | 8:00 am | −0.456a | |||||||||||||||
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PER2 | CID2/CID1 | 8:00 am | |||||||||||||||
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TEF | CID2/CID1 | 8:00 am | 0.410a | ||||||||||||||
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CID3/CID1 | 8:00 am | 0.450a | 0.401a | ||||||||||||||
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3:45 pm | 0.394a |
Genes and parameters demonstrating significant expression changes in response on LC/HFD are shown (Supplemental Table 2). Parameter alterations were analyzed after 1 week (CID2/CID1) and 6 weeks (CID3/CID1) in the morning after overnight fasting (biochemical parameters) or at 3 time points (gene expression). Only significant correlation links (r values) are presented. Correlations significant after false discovery rate correction are in italics.
P < .05 without correction for multiple testing.
P < 0.01 without correction for multiple testing.
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