Proportion of TDV-2, revertants, and DENV-2 in complex mixtures using UMIs.
RNA . | Complex Mix 1 . | Complex Mix 2 . | Complex Mix 3 . | Complex Mix 4 . | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
UMIa (%) . | Expected (%) . | Difference (|E-U|)b . | UMI (%) . | Expected (%) . | Difference (|E-U|)b . | UMI (%) . | Expected (%) . | Difference (|E-U|)b . | UMI (%) . | Expected (%) . | Difference (|E-U|)b . | |
P1 | 23.27 | 35 | 11.73 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
P3 | 57.76 | 50 | 7.76 | 10.84 | 10 | 0.84 | 9.62 | 10 | 0.38 | NA | NA | NA |
P5 | 6.89 | 5 | 1.89 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
P51 | NA | NA | NA | 21.56 | 20 | 1.56 | 25.12 | 20 | 5.12 | NA | NA | NA |
P513 | NA | NA | NA | 37.16 | 40 | 2.84 | 64.89c | 40 | 5.11 | NA | NA | NA |
wt DENV-2 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 30 | 65.57 | 75 | 9.43 | ||
TDV-2 | 11.2 | 10 | 1.2 | 29.59 | 30 | 0.41 | NA | NA | NA | 33.7 | 25 | 8.7 |
RNA . | Complex Mix 1 . | Complex Mix 2 . | Complex Mix 3 . | Complex Mix 4 . | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
UMIa (%) . | Expected (%) . | Difference (|E-U|)b . | UMI (%) . | Expected (%) . | Difference (|E-U|)b . | UMI (%) . | Expected (%) . | Difference (|E-U|)b . | UMI (%) . | Expected (%) . | Difference (|E-U|)b . | |
P1 | 23.27 | 35 | 11.73 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
P3 | 57.76 | 50 | 7.76 | 10.84 | 10 | 0.84 | 9.62 | 10 | 0.38 | NA | NA | NA |
P5 | 6.89 | 5 | 1.89 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
P51 | NA | NA | NA | 21.56 | 20 | 1.56 | 25.12 | 20 | 5.12 | NA | NA | NA |
P513 | NA | NA | NA | 37.16 | 40 | 2.84 | 64.89c | 40 | 5.11 | NA | NA | NA |
wt DENV-2 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 30 | 65.57 | 75 | 9.43 | ||
TDV-2 | 11.2 | 10 | 1.2 | 29.59 | 30 | 0.41 | NA | NA | NA | 33.7 | 25 | 8.7 |
Proportion of TDV-2, revertants, and DENV-2 in complex mixtures using UMIs.
RNA . | Complex Mix 1 . | Complex Mix 2 . | Complex Mix 3 . | Complex Mix 4 . | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
UMIa (%) . | Expected (%) . | Difference (|E-U|)b . | UMI (%) . | Expected (%) . | Difference (|E-U|)b . | UMI (%) . | Expected (%) . | Difference (|E-U|)b . | UMI (%) . | Expected (%) . | Difference (|E-U|)b . | |
P1 | 23.27 | 35 | 11.73 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
P3 | 57.76 | 50 | 7.76 | 10.84 | 10 | 0.84 | 9.62 | 10 | 0.38 | NA | NA | NA |
P5 | 6.89 | 5 | 1.89 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
P51 | NA | NA | NA | 21.56 | 20 | 1.56 | 25.12 | 20 | 5.12 | NA | NA | NA |
P513 | NA | NA | NA | 37.16 | 40 | 2.84 | 64.89c | 40 | 5.11 | NA | NA | NA |
wt DENV-2 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 30 | 65.57 | 75 | 9.43 | ||
TDV-2 | 11.2 | 10 | 1.2 | 29.59 | 30 | 0.41 | NA | NA | NA | 33.7 | 25 | 8.7 |
RNA . | Complex Mix 1 . | Complex Mix 2 . | Complex Mix 3 . | Complex Mix 4 . | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
UMIa (%) . | Expected (%) . | Difference (|E-U|)b . | UMI (%) . | Expected (%) . | Difference (|E-U|)b . | UMI (%) . | Expected (%) . | Difference (|E-U|)b . | UMI (%) . | Expected (%) . | Difference (|E-U|)b . | |
P1 | 23.27 | 35 | 11.73 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
P3 | 57.76 | 50 | 7.76 | 10.84 | 10 | 0.84 | 9.62 | 10 | 0.38 | NA | NA | NA |
P5 | 6.89 | 5 | 1.89 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
P51 | NA | NA | NA | 21.56 | 20 | 1.56 | 25.12 | 20 | 5.12 | NA | NA | NA |
P513 | NA | NA | NA | 37.16 | 40 | 2.84 | 64.89c | 40 | 5.11 | NA | NA | NA |
wt DENV-2 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 30 | 65.57 | 75 | 9.43 | ||
TDV-2 | 11.2 | 10 | 1.2 | 29.59 | 30 | 0.41 | NA | NA | NA | 33.7 | 25 | 8.7 |
This PDF is available to Subscribers Only
View Article Abstract & Purchase OptionsFor full access to this pdf, sign in to an existing account, or purchase an annual subscription.