Table 4. Open in new tab Differentially...

Treatment*	Expression regulation	DEGs in chromosome
L0 vs. U0	Up	279	172	163	151	101	123	117	118	99	115	174	97	1709
Down	509	379	444	350	312	294	257	217	158	207	251	190	3568
Total	788	551	607	501	413	417	374	335	257	322	425	287	5277
L24 vs. U24	Up	440	310	275	264	182	229	219	181	165	171	212	131	2779
Down	493	359	382	371	276	280	257	230	164	195	246	184	3437
Total	933	669	657	635	458	509	476	411	329	366	458	315	6216
L48 vs. U48	Up	587	493	477	357	330	345	316	283	197	228	332	235	4180
Down	412	309	308	299	199	225	208	174	156	139	214	153	2796
Total	999	802	785	656	529	570	524	457	353	367	546	388	6976
L72 vs. U72	Up	279	213	180	155	124	170	141	164	94	130	201	119	1970
Down	467	313	361	296	249	241	242	186	148	159	219	193	3074
Total	746	526	541	451	373	411	383	350	242	289	420	312	5044
U0 vs. U24	Up	141	83	105	123	72	70	72	44	60	70	88	51	979
Down	236	156	155	152	96	100	119	94	93	87	122	87	1497
Total	377	239	260	275	168	170	191	138	153	157	210	138	2476
U0 vs. U48	Up	617	404	474	420	285	338	287	253	237	223	309	210	4057
Down	851	671	793	548	484	454	441	388	306	296	326	332	5890
Total	1468	1075	1267	968	769	792	728	641	543	519	635	542	9947
U0 vs. U72	Up	477	315	344	298	223	269	237	200	161	166	243	204	3137
Down	580	445	524	369	358	313	283	284	188	217	239	220	4020
Total	1057	760	868	667	581	582	520	484	349	383	482	424	7157

Treatment*

Expression regulation

DEGs in chromosome

Total

L0 vs. U0

279

172

163

151

101

123

117

118

115

174

1709

Down

509

379

444

350

312

294

257

217

158

207

251

190

3568

Total

788

551

607

501

413

417

374

335

257

322

425

287

5277

L24 vs. U24

440

310

275

264

182

229

219

181

165

171

212

131

2779

Down

493

359

382

371

276

280

257

230

164

195

246

184

3437

Total

933

669

657

635

458

509

476

411

329

366

458

315

6216

L48 vs. U48

587

493

477

357

330

345

316

283

197

228

332

235

4180

Down

412

309

308

299

199

225

208

174

156

139

214

153

2796

Total

999

802

785

656

529

570

524

457

353

367

546

388

6976

L72 vs. U72

279

213

180

155

124

170

141

164

130

201

119

1970

Down

467

313

361

296

249

241

242

186

148

159

219

193

3074

Total

746

526

541

451

373

411

383

350

242

289

420

312

5044

U0 vs. U24

141

105

123

979

Down

236

156

155

152

100

119

122

1497

Total

377

239

260

275

168

170

191

138

153

157

210

138

2476

U0 vs. U48

617

404

474

420

285

338

287

253

237

223

309

210

4057

Down

851

671

793

548

484

454

441

388

306

296

326

332

5890

Total

1468

1075

1267

968

769

792

728

641

543

519

635

542

9947

U0 vs. U72

477

315

344

298

223

269

237

200

161

166

243

204

3137

Down

580

445

524

369

358

313

283

284

188

217

239

220

4020

Total

1057

760

868

667

581

582

520

484

349

383

482

424

7157

Treatment*	Expression regulation	DEGs in chromosome
L0 vs. U0	Up	279	172	163	151	101	123	117	118	99	115	174	97	1709
Down	509	379	444	350	312	294	257	217	158	207	251	190	3568
Total	788	551	607	501	413	417	374	335	257	322	425	287	5277
L24 vs. U24	Up	440	310	275	264	182	229	219	181	165	171	212	131	2779
Down	493	359	382	371	276	280	257	230	164	195	246	184	3437
Total	933	669	657	635	458	509	476	411	329	366	458	315	6216
L48 vs. U48	Up	587	493	477	357	330	345	316	283	197	228	332	235	4180
Down	412	309	308	299	199	225	208	174	156	139	214	153	2796
Total	999	802	785	656	529	570	524	457	353	367	546	388	6976
L72 vs. U72	Up	279	213	180	155	124	170	141	164	94	130	201	119	1970
Down	467	313	361	296	249	241	242	186	148	159	219	193	3074
Total	746	526	541	451	373	411	383	350	242	289	420	312	5044
U0 vs. U24	Up	141	83	105	123	72	70	72	44	60	70	88	51	979
Down	236	156	155	152	96	100	119	94	93	87	122	87	1497
Total	377	239	260	275	168	170	191	138	153	157	210	138	2476
U0 vs. U48	Up	617	404	474	420	285	338	287	253	237	223	309	210	4057
Down	851	671	793	548	484	454	441	388	306	296	326	332	5890
Total	1468	1075	1267	968	769	792	728	641	543	519	635	542	9947
U0 vs. U72	Up	477	315	344	298	223	269	237	200	161	166	243	204	3137
Down	580	445	524	369	358	313	283	284	188	217	239	220	4020
Total	1057	760	868	667	581	582	520	484	349	383	482	424	7157

Table 4.

Open in new tab

Differentially expressed genes between susceptible (LTH) and resistant (UR0803) under various treatments including 0, 24, 48 and 72 h after inoculation.

Treatment*	Expression regulation	DEGs in chromosome
Treatment*	Expression regulation	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	Total
L0 vs. U0	Up	279	172	163	151	101	123	117	118	99	115	174	97	1709
	Down	509	379	444	350	312	294	257	217	158	207	251	190	3568
	Total	788	551	607	501	413	417	374	335	257	322	425	287	5277
L24 vs. U24	Up	440	310	275	264	182	229	219	181	165	171	212	131	2779
	Down	493	359	382	371	276	280	257	230	164	195	246	184	3437
	Total	933	669	657	635	458	509	476	411	329	366	458	315	6216
L48 vs. U48	Up	587	493	477	357	330	345	316	283	197	228	332	235	4180
	Down	412	309	308	299	199	225	208	174	156	139	214	153	2796
	Total	999	802	785	656	529	570	524	457	353	367	546	388	6976
L72 vs. U72	Up	279	213	180	155	124	170	141	164	94	130	201	119	1970
	Down	467	313	361	296	249	241	242	186	148	159	219	193	3074
	Total	746	526	541	451	373	411	383	350	242	289	420	312	5044
U0 vs. U24	Up	141	83	105	123	72	70	72	44	60	70	88	51	979
	Down	236	156	155	152	96	100	119	94	93	87	122	87	1497
	Total	377	239	260	275	168	170	191	138	153	157	210	138	2476
U0 vs. U48	Up	617	404	474	420	285	338	287	253	237	223	309	210	4057
	Down	851	671	793	548	484	454	441	388	306	296	326	332	5890
	Total	1468	1075	1267	968	769	792	728	641	543	519	635	542	9947
U0 vs. U72	Up	477	315	344	298	223	269	237	200	161	166	243	204	3137
	Down	580	445	524	369	358	313	283	284	188	217	239	220	4020
	Total	1057	760	868	667	581	582	520	484	349	383	482	424	7157

Treatment*	Expression regulation	DEGs in chromosome
Treatment*	Expression regulation	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	Total
L0 vs. U0	Up	279	172	163	151	101	123	117	118	99	115	174	97	1709
	Down	509	379	444	350	312	294	257	217	158	207	251	190	3568
	Total	788	551	607	501	413	417	374	335	257	322	425	287	5277
L24 vs. U24	Up	440	310	275	264	182	229	219	181	165	171	212	131	2779
	Down	493	359	382	371	276	280	257	230	164	195	246	184	3437
	Total	933	669	657	635	458	509	476	411	329	366	458	315	6216
L48 vs. U48	Up	587	493	477	357	330	345	316	283	197	228	332	235	4180
	Down	412	309	308	299	199	225	208	174	156	139	214	153	2796
	Total	999	802	785	656	529	570	524	457	353	367	546	388	6976
L72 vs. U72	Up	279	213	180	155	124	170	141	164	94	130	201	119	1970
	Down	467	313	361	296	249	241	242	186	148	159	219	193	3074
	Total	746	526	541	451	373	411	383	350	242	289	420	312	5044
U0 vs. U24	Up	141	83	105	123	72	70	72	44	60	70	88	51	979
	Down	236	156	155	152	96	100	119	94	93	87	122	87	1497
	Total	377	239	260	275	168	170	191	138	153	157	210	138	2476
U0 vs. U48	Up	617	404	474	420	285	338	287	253	237	223	309	210	4057
	Down	851	671	793	548	484	454	441	388	306	296	326	332	5890
	Total	1468	1075	1267	968	769	792	728	641	543	519	635	542	9947
U0 vs. U72	Up	477	315	344	298	223	269	237	200	161	166	243	204	3137
	Down	580	445	524	369	358	313	283	284	188	217	239	220	4020
	Total	1057	760	868	667	581	582	520	484	349	383	482	424	7157

*In treatments ‘L’ stands for LTH, and ‘U’ stands for UR0803; 0, 24, 48 and 72 indicate that the RNA samples collected after 0, 24, 48 and 72 h after inoculation of Magnaporthe oryzae.

This Feature Is Available To Subscribers Only