Table 2 Open in new tab Summarized... | Oxford Academic

Table 2

Open in new tab

Summarized performances for all methods and datasets. |$F1_m$| and |$MCC_m$| are the best F1 and MCC along the precision-recall curve. |$\hat{AUC}_{pr}$| is the logarithmic ratio of the area under the precision-recall curve.

	CEL			DME			AGA			HSA			ATH
\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|	\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|	\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|	\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|	\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|
OC-SVM	0.012	0.047	0.342	0.002	0.015	0.292	0.013	0.033	0.240	0.004	0.014	0.197	0.153	0.121	0.625
deepBN	0.009	0.025	0.220	0.000	0.002	0.044	0.001	0.007	0.002	0.006	0.016	0.241	0.143	0.148	0.595
deeSOM	0.037	0.063	0.378	0.075	0.120	0.166	0.019	0.023	0.367	0.028	0.035	0.365	0.172	0.187	0.649
miRNAss	0.030	0.044	0.357	0.001	0.005	0.020	0.008	0.007	0.071	-	-	-	0.212	0.173	0.676
bb-DeepMir	0.028	0.023	0.190	0.053	0.015	0.048	0.009	0.009	0.109	0.038	0.050	0.457	0.085	0.060	0.475
bb-deepMiRGene	0.103	0.095	0.567	0.060	0.040	0.387	0.058	0.045	0.336	0.072	0.031	0.511	0.195	0.179	0.686

	CEL			DME			AGA			HSA			ATH
\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|	\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|	\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|	\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|	\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|
OC-SVM	0.012	0.047	0.342	0.002	0.015	0.292	0.013	0.033	0.240	0.004	0.014	0.197	0.153	0.121	0.625
deepBN	0.009	0.025	0.220	0.000	0.002	0.044	0.001	0.007	0.002	0.006	0.016	0.241	0.143	0.148	0.595
deeSOM	0.037	0.063	0.378	0.075	0.120	0.166	0.019	0.023	0.367	0.028	0.035	0.365	0.172	0.187	0.649
miRNAss	0.030	0.044	0.357	0.001	0.005	0.020	0.008	0.007	0.071	-	-	-	0.212	0.173	0.676
bb-DeepMir	0.028	0.023	0.190	0.053	0.015	0.048	0.009	0.009	0.109	0.038	0.050	0.457	0.085	0.060	0.475
bb-deepMiRGene	0.103	0.095	0.567	0.060	0.040	0.387	0.058	0.045	0.336	0.072	0.031	0.511	0.195	0.179	0.686

Table 2

Open in new tab

Summarized performances for all methods and datasets. |$F1_m$| and |$MCC_m$| are the best F1 and MCC along the precision-recall curve. |$\hat{AUC}_{pr}$| is the logarithmic ratio of the area under the precision-recall curve.

	CEL			DME			AGA			HSA			ATH
\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|	\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|	\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|	\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|	\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|
OC-SVM	0.012	0.047	0.342	0.002	0.015	0.292	0.013	0.033	0.240	0.004	0.014	0.197	0.153	0.121	0.625
deepBN	0.009	0.025	0.220	0.000	0.002	0.044	0.001	0.007	0.002	0.006	0.016	0.241	0.143	0.148	0.595
deeSOM	0.037	0.063	0.378	0.075	0.120	0.166	0.019	0.023	0.367	0.028	0.035	0.365	0.172	0.187	0.649
miRNAss	0.030	0.044	0.357	0.001	0.005	0.020	0.008	0.007	0.071	-	-	-	0.212	0.173	0.676
bb-DeepMir	0.028	0.023	0.190	0.053	0.015	0.048	0.009	0.009	0.109	0.038	0.050	0.457	0.085	0.060	0.475
bb-deepMiRGene	0.103	0.095	0.567	0.060	0.040	0.387	0.058	0.045	0.336	0.072	0.031	0.511	0.195	0.179	0.686

	CEL			DME			AGA			HSA			ATH
\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|	\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|	\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|	\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|	\|$F1_m$\|	\|$MCC_m$\|	\|$\hat{AUC}_{pr}$\|
OC-SVM	0.012	0.047	0.342	0.002	0.015	0.292	0.013	0.033	0.240	0.004	0.014	0.197	0.153	0.121	0.625
deepBN	0.009	0.025	0.220	0.000	0.002	0.044	0.001	0.007	0.002	0.006	0.016	0.241	0.143	0.148	0.595
deeSOM	0.037	0.063	0.378	0.075	0.120	0.166	0.019	0.023	0.367	0.028	0.035	0.365	0.172	0.187	0.649
miRNAss	0.030	0.044	0.357	0.001	0.005	0.020	0.008	0.007	0.071	-	-	-	0.212	0.173	0.676
bb-DeepMir	0.028	0.023	0.190	0.053	0.015	0.048	0.009	0.009	0.109	0.038	0.050	0.457	0.085	0.060	0.475
bb-deepMiRGene	0.103	0.095	0.567	0.060	0.040	0.387	0.058	0.045	0.336	0.072	0.031	0.511	0.195	0.179	0.686