| Isolates, No. . | Subtype . | Percentage . | Amino Acid Position, Reference Sequence . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5, N . | 6, L . | 9, A . | 10, R . | 21, S . | 27, A . | 30, E . | 33, L . | 53, A . | 68, S . | 69, A . | 88, P . | 106, H . | 112, D . | 118, K . | 119, D . | 123, T . | 143, K . | 146, S . | 154, A . | 172, V . | 181, V . | 182, G . | 184, P . | 188, D . | 199, D . | 209, D . | 220, E . | 225, S . | 229, P . | 236, P . | 237, V . | 256, N . | 275, A . | 285, S . | |||
| 431 | 1 | 47.8 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 141 | 2 | 15.6 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 62 | 3 | 6.9 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | - | - | - |
| 59 | 4 | 6.5 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 50 | 5 | 5.5 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | - | - | - |
| 27 | 6 | 3.0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Y | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 19 | 7 | 2.1 | - | F | G | - | P | - | - | M | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 15 | 8 | 1.7 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 12 | 9 | 1.3 | - | F | G | - | P | - | K | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 10 | 10 | 1.1 | - | - | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 9 | 11 | 1.0 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 9 | 12 | 1.0 | - | F | G | - | P | - | K | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 6 | 13 | 0.7 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | - |
| 6 | 14 | 0.7 | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | E | A | - | - | G | - | L | - | - | - | G | G | N | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 5 | 15 | 0.6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | I |
| 3 | 16 | 0.3 | - | F | S | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 17 | 0.2 | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 18 | 0.2 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | V | I |
| 2 | 19 | 0.2 | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | N | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 20 | 0.2 | - | F | S | - | Q | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 21 | 0.2 | - | F | G | - | P | - | K | - | - | - | - | - | Y | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 22 | 0.2 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | S | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 23 | 0.2 | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | E | A | - | - | G | - | L | - | - | - | G | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 24 | 0.2 | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | E | A | - | - | G | - | L | - | - | - | G | G | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 25 | 0.1 | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 26 | 0.1 | - | - | - | S | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 27 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 28 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 29 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | S | - | - | - | - | - |
| 1 | 30 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | S | - | - | - | - |
| 1 | 31 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | D | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 32 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | L | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 33 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Y | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 34 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 35 | 0.1 | - | - | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 36 | 0.1 | S | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 37 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | L | A | - | - | G | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 38 | 0.1 | - | F | G | - | P | - | - | M | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 39 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 40 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 41 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 42 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | I | - | - | - |
| 1 | 43 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | S | - | - |
| 1 | 44 | 0.1 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 45 | 0.1 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | D | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 46 | 0.1 | - | F | G | - | P | - | K | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | R | - | - | - | - | - | - |
| Isolates, No. . | Subtype . | Percentage . | Amino Acid Position, Reference Sequence . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5, N . | 6, L . | 9, A . | 10, R . | 21, S . | 27, A . | 30, E . | 33, L . | 53, A . | 68, S . | 69, A . | 88, P . | 106, H . | 112, D . | 118, K . | 119, D . | 123, T . | 143, K . | 146, S . | 154, A . | 172, V . | 181, V . | 182, G . | 184, P . | 188, D . | 199, D . | 209, D . | 220, E . | 225, S . | 229, P . | 236, P . | 237, V . | 256, N . | 275, A . | 285, S . | |||
| 431 | 1 | 47.8 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 141 | 2 | 15.6 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 62 | 3 | 6.9 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | - | - | - |
| 59 | 4 | 6.5 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 50 | 5 | 5.5 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | - | - | - |
| 27 | 6 | 3.0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Y | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 19 | 7 | 2.1 | - | F | G | - | P | - | - | M | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 15 | 8 | 1.7 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 12 | 9 | 1.3 | - | F | G | - | P | - | K | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 10 | 10 | 1.1 | - | - | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 9 | 11 | 1.0 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 9 | 12 | 1.0 | - | F | G | - | P | - | K | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 6 | 13 | 0.7 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | - |
| 6 | 14 | 0.7 | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | E | A | - | - | G | - | L | - | - | - | G | G | N | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 5 | 15 | 0.6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | I |
| 3 | 16 | 0.3 | - | F | S | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 17 | 0.2 | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 18 | 0.2 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | V | I |
| 2 | 19 | 0.2 | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | N | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 20 | 0.2 | - | F | S | - | Q | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 21 | 0.2 | - | F | G | - | P | - | K | - | - | - | - | - | Y | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 22 | 0.2 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | S | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 23 | 0.2 | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | E | A | - | - | G | - | L | - | - | - | G | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 24 | 0.2 | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | E | A | - | - | G | - | L | - | - | - | G | G | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 25 | 0.1 | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 26 | 0.1 | - | - | - | S | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 27 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 28 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 29 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | S | - | - | - | - | - |
| 1 | 30 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | S | - | - | - | - |
| 1 | 31 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | D | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 32 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | L | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 33 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Y | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 34 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 35 | 0.1 | - | - | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 36 | 0.1 | S | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 37 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | L | A | - | - | G | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 38 | 0.1 | - | F | G | - | P | - | - | M | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 39 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 40 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 41 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 42 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | I | - | - | - |
| 1 | 43 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | S | - | - |
| 1 | 44 | 0.1 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 45 | 0.1 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | D | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 46 | 0.1 | - | F | G | - | P | - | K | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | R | - | - | - | - | - | - |
The sequence of pcrV was determined by whole-genome sequencing followed by translation of amino acid protein sequences. PcrV amino acid sequences of clinical isolates were compared to data from reference strain PAO1 published by Stover et al [3].
| Isolates, No. . | Subtype . | Percentage . | Amino Acid Position, Reference Sequence . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5, N . | 6, L . | 9, A . | 10, R . | 21, S . | 27, A . | 30, E . | 33, L . | 53, A . | 68, S . | 69, A . | 88, P . | 106, H . | 112, D . | 118, K . | 119, D . | 123, T . | 143, K . | 146, S . | 154, A . | 172, V . | 181, V . | 182, G . | 184, P . | 188, D . | 199, D . | 209, D . | 220, E . | 225, S . | 229, P . | 236, P . | 237, V . | 256, N . | 275, A . | 285, S . | |||
| 431 | 1 | 47.8 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 141 | 2 | 15.6 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 62 | 3 | 6.9 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | - | - | - |
| 59 | 4 | 6.5 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 50 | 5 | 5.5 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | - | - | - |
| 27 | 6 | 3.0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Y | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 19 | 7 | 2.1 | - | F | G | - | P | - | - | M | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 15 | 8 | 1.7 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 12 | 9 | 1.3 | - | F | G | - | P | - | K | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 10 | 10 | 1.1 | - | - | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 9 | 11 | 1.0 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 9 | 12 | 1.0 | - | F | G | - | P | - | K | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 6 | 13 | 0.7 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | - |
| 6 | 14 | 0.7 | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | E | A | - | - | G | - | L | - | - | - | G | G | N | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 5 | 15 | 0.6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | I |
| 3 | 16 | 0.3 | - | F | S | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 17 | 0.2 | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 18 | 0.2 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | V | I |
| 2 | 19 | 0.2 | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | N | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 20 | 0.2 | - | F | S | - | Q | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 21 | 0.2 | - | F | G | - | P | - | K | - | - | - | - | - | Y | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 22 | 0.2 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | S | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 23 | 0.2 | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | E | A | - | - | G | - | L | - | - | - | G | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 24 | 0.2 | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | E | A | - | - | G | - | L | - | - | - | G | G | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 25 | 0.1 | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 26 | 0.1 | - | - | - | S | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 27 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 28 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 29 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | S | - | - | - | - | - |
| 1 | 30 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | S | - | - | - | - |
| 1 | 31 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | D | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 32 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | L | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 33 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Y | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 34 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 35 | 0.1 | - | - | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 36 | 0.1 | S | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 37 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | L | A | - | - | G | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 38 | 0.1 | - | F | G | - | P | - | - | M | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 39 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 40 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 41 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 42 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | I | - | - | - |
| 1 | 43 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | S | - | - |
| 1 | 44 | 0.1 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 45 | 0.1 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | D | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 46 | 0.1 | - | F | G | - | P | - | K | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | R | - | - | - | - | - | - |
| Isolates, No. . | Subtype . | Percentage . | Amino Acid Position, Reference Sequence . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5, N . | 6, L . | 9, A . | 10, R . | 21, S . | 27, A . | 30, E . | 33, L . | 53, A . | 68, S . | 69, A . | 88, P . | 106, H . | 112, D . | 118, K . | 119, D . | 123, T . | 143, K . | 146, S . | 154, A . | 172, V . | 181, V . | 182, G . | 184, P . | 188, D . | 199, D . | 209, D . | 220, E . | 225, S . | 229, P . | 236, P . | 237, V . | 256, N . | 275, A . | 285, S . | |||
| 431 | 1 | 47.8 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 141 | 2 | 15.6 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 62 | 3 | 6.9 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | - | - | - |
| 59 | 4 | 6.5 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 50 | 5 | 5.5 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | - | - | - |
| 27 | 6 | 3.0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Y | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 19 | 7 | 2.1 | - | F | G | - | P | - | - | M | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 15 | 8 | 1.7 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 12 | 9 | 1.3 | - | F | G | - | P | - | K | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 10 | 10 | 1.1 | - | - | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 9 | 11 | 1.0 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 9 | 12 | 1.0 | - | F | G | - | P | - | K | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 6 | 13 | 0.7 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | - |
| 6 | 14 | 0.7 | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | E | A | - | - | G | - | L | - | - | - | G | G | N | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 5 | 15 | 0.6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | I |
| 3 | 16 | 0.3 | - | F | S | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 17 | 0.2 | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 18 | 0.2 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | V | I |
| 2 | 19 | 0.2 | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | N | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 20 | 0.2 | - | F | S | - | Q | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 21 | 0.2 | - | F | G | - | P | - | K | - | - | - | - | - | Y | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 22 | 0.2 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | S | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 23 | 0.2 | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | E | A | - | - | G | - | L | - | - | - | G | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 2 | 24 | 0.2 | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | E | A | - | - | G | - | L | - | - | - | G | G | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 25 | 0.1 | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 26 | 0.1 | - | - | - | S | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 27 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 28 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 29 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | S | - | - | - | - | - |
| 1 | 30 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | S | - | - | - | - |
| 1 | 31 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | D | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 32 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | L | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 33 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Y | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 34 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 35 | 0.1 | - | - | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 36 | 0.1 | S | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 37 | 0.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | L | A | - | - | G | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 38 | 0.1 | - | F | G | - | P | - | - | M | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 39 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 40 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 41 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 42 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | I | - | - | - |
| 1 | 43 | 0.1 | - | F | - | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | - | - | - | S | - | - |
| 1 | 44 | 0.1 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 45 | 0.1 | - | F | G | - | P | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | D | - | - | - | - | - | R | - | - | - | - | - | - |
| 1 | 46 | 0.1 | - | F | G | - | P | - | K | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | K | R | - | - | - | - | - | - |
The sequence of pcrV was determined by whole-genome sequencing followed by translation of amino acid protein sequences. PcrV amino acid sequences of clinical isolates were compared to data from reference strain PAO1 published by Stover et al [3].
This PDF is available to Subscribers Only
View Article Abstract & Purchase OptionsFor full access to this pdf, sign in to an existing account, or purchase an annual subscription.
